MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-3

Total Repeats: 735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017233	AAT	2	6	55	60	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017233	ATTA	2	8	82	89	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017233	TAA	2	6	145	150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017233	TAT	2	6	153	158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017233	GTC	2	6	175	180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017233	TC	3	6	184	189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017233	T	6	6	210	215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017233	CT	3	6	221	226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017233	ATTT	2	8	280	287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017233	A	6	6	304	309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017233	TAT	2	6	322	327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017233	CAAA	2	8	332	339	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017233	AT	3	6	343	348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017233	TTAA	2	8	353	360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017233	ATTA	2	8	368	375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017233	TAAT	2	8	377	384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017233	TTA	2	6	389	394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017233	A	6	6	396	401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017233	GTTT	2	8	447	454	0 %	75 %	25 %	0 %	384206298
20	NC_017233	TA	3	6	456	461	50 %	50 %	0 %	0 %	384206298
21	NC_017233	ATT	2	6	463	468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206298
22	NC_017233	TAG	2	6	471	476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206298
23	NC_017233	TAA	2	6	514	519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206298
24	NC_017233	A	7	7	525	531	100 %	0 %	0 %	0 %	384206298
25	NC_017233	AAT	2	6	536	541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206298
26	NC_017233	AGA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206298
27	NC_017233	TA	3	6	588	593	50 %	50 %	0 %	0 %	384206298
28	NC_017233	AAG	2	6	600	605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206298
29	NC_017233	TAAT	2	8	654	661	50 %	50 %	0 %	0 %	384206298
30	NC_017233	ATA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206298
31	NC_017233	TGA	2	6	718	723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206298
32	NC_017233	A	8	8	732	739	100 %	0 %	0 %	0 %	384206298
33	NC_017233	A	7	7	745	751	100 %	0 %	0 %	0 %	384206298
34	NC_017233	TGA	2	6	772	777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206298
35	NC_017233	AG	3	6	783	788	50 %	0 %	50 %	0 %	384206298
36	NC_017233	AATT	2	8	843	850	50 %	50 %	0 %	0 %	384206298
37	NC_017233	GAA	2	6	851	856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206298
38	NC_017233	TAA	2	6	885	890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206298
39	NC_017233	ATG	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206298
40	NC_017233	A	6	6	915	920	100 %	0 %	0 %	0 %	384206298
41	NC_017233	A	7	7	929	935	100 %	0 %	0 %	0 %	384206298
42	NC_017233	CAC	2	6	936	941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206298
43	NC_017233	AAT	2	6	959	964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206298
44	NC_017233	ATAA	2	8	974	981	75 %	25 %	0 %	0 %	384206298
45	NC_017233	GGA	2	6	994	999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206298
46	NC_017233	AGAT	2	8	1011	1018	50 %	25 %	25 %	0 %	384206298
47	NC_017233	ATA	2	6	1067	1072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206298
48	NC_017233	CTG	2	6	1074	1079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206298
49	NC_017233	T	6	6	1085	1090	0 %	100 %	0 %	0 %	384206298
50	NC_017233	TAT	2	6	1120	1125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206298
51	NC_017233	AG	3	6	1135	1140	50 %	0 %	50 %	0 %	384206298
52	NC_017233	AAG	2	6	1195	1200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206298
53	NC_017233	T	8	8	1222	1229	0 %	100 %	0 %	0 %	384206298
54	NC_017233	GAA	2	6	1251	1256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206298
55	NC_017233	AGAA	3	12	1253	1264	75 %	0 %	25 %	0 %	384206298
56	NC_017233	TTA	2	6	1275	1280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206298
57	NC_017233	CAA	2	6	1309	1314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206298
58	NC_017233	A	6	6	1313	1318	100 %	0 %	0 %	0 %	384206298
59	NC_017233	TAA	2	6	1319	1324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206298
60	NC_017233	GAA	2	6	1418	1423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017233	ATCT	2	8	1425	1432	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017233	ATT	2	6	1482	1487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017233	AGG	2	6	1488	1493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017233	A	7	7	1507	1513	100 %	0 %	0 %	0 %	384206299
65	NC_017233	ATTAAT	2	12	1521	1532	50 %	50 %	0 %	0 %	384206299
66	NC_017233	AGA	2	6	1563	1568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206299
67	NC_017233	ACT	2	6	1600	1605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206299
68	NC_017233	T	7	7	1660	1666	0 %	100 %	0 %	0 %	384206299
69	NC_017233	TGG	3	9	1704	1712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206299
70	NC_017233	AGG	2	6	1737	1742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206299
71	NC_017233	AAT	2	6	1761	1766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206299
72	NC_017233	TGG	2	6	1770	1775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206299
73	NC_017233	AAT	2	6	1815	1820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206299
74	NC_017233	CAG	2	6	1844	1849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206299
75	NC_017233	ATT	2	6	1867	1872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206299
76	NC_017233	A	7	7	1911	1917	100 %	0 %	0 %	0 %	384206299
77	NC_017233	A	7	7	1987	1993	100 %	0 %	0 %	0 %	384206299
78	NC_017233	TTA	2	6	1995	2000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206299
79	NC_017233	AAT	2	6	2102	2107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206300
80	NC_017233	TCT	2	6	2140	2145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206300
81	NC_017233	T	6	6	2148	2153	0 %	100 %	0 %	0 %	384206300
82	NC_017233	ATT	2	6	2232	2237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017233	TTCTTT	2	12	2238	2249	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017233	T	7	7	2247	2253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017233	T	7	7	2270	2276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017233	GTC	2	6	2293	2298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017233	CCA	2	6	2326	2331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017233	A	7	7	2352	2358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017233	GATA	2	8	2432	2439	50 %	25 %	25 %	0 %	384206301
90	NC_017233	CTTT	2	8	2500	2507	0 %	75 %	0 %	25 %	384206301
91	NC_017233	TAT	2	6	2540	2545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206301
92	NC_017233	AG	3	6	2555	2560	50 %	0 %	50 %	0 %	384206301
93	NC_017233	AAG	2	6	2633	2638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017233	TAA	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017233	AAC	2	6	2792	2797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017233	A	6	6	2811	2816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017233	TAAA	2	8	2825	2832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017233	TGG	2	6	2850	2855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017233	TTTA	3	12	2869	2880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017233	ATA	2	6	2920	2925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017233	ATT	2	6	2944	2949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017233	AAT	2	6	2981	2986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017233	AAAT	2	8	2992	2999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017233	ATA	2	6	3016	3021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017233	ATT	2	6	3053	3058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017233	AT	4	8	3064	3071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017233	TTA	2	6	3072	3077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017233	ATATT	3	15	3100	3114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017233	ATATA	2	10	3117	3126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017233	ATATA	2	10	3156	3165	60 %	40 %	0 %	0 %	384206302
111	NC_017233	T	7	7	3182	3188	0 %	100 %	0 %	0 %	384206302
112	NC_017233	A	6	6	3253	3258	100 %	0 %	0 %	0 %	384206302
113	NC_017233	ACA	2	6	3295	3300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206302
114	NC_017233	AAG	2	6	3314	3319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206302
115	NC_017233	A	6	6	3335	3340	100 %	0 %	0 %	0 %	384206302
116	NC_017233	TAA	2	6	3345	3350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206302
117	NC_017233	A	6	6	3357	3362	100 %	0 %	0 %	0 %	384206302
118	NC_017233	A	7	7	3426	3432	100 %	0 %	0 %	0 %	384206302
119	NC_017233	GAA	3	9	3436	3444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206302
120	NC_017233	A	6	6	3475	3480	100 %	0 %	0 %	0 %	384206302
121	NC_017233	TGGG	2	8	3487	3494	0 %	25 %	75 %	0 %	384206302
122	NC_017233	ATA	2	6	3521	3526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206302
123	NC_017233	AT	3	6	3552	3557	50 %	50 %	0 %	0 %	384206302
124	NC_017233	TAA	2	6	3585	3590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206302
125	NC_017233	GAC	2	6	3676	3681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206302
126	NC_017233	A	6	6	3703	3708	100 %	0 %	0 %	0 %	384206302
127	NC_017233	TAAA	2	8	3716	3723	75 %	25 %	0 %	0 %	384206302
128	NC_017233	ATT	2	6	3768	3773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206302
129	NC_017233	TTA	2	6	3814	3819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206302
130	NC_017233	ATA	2	6	3830	3835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206302
131	NC_017233	ACAA	2	8	3890	3897	75 %	0 %	0 %	25 %	384206302
132	NC_017233	A	8	8	3903	3910	100 %	0 %	0 %	0 %	384206302
133	NC_017233	GAA	2	6	3913	3918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206302
134	NC_017233	A	6	6	3930	3935	100 %	0 %	0 %	0 %	384206302
135	NC_017233	AT	3	6	3949	3954	50 %	50 %	0 %	0 %	384206302
136	NC_017233	TAAA	2	8	4115	4122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017233	CTT	2	6	4123	4128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017233	ATA	2	6	4162	4167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017233	TAA	2	6	4196	4201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017233	AT	3	6	4236	4241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017233	ACT	2	6	4244	4249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017233	TAGTAA	2	12	4269	4280	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384206303
143	NC_017233	ATT	2	6	4298	4303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206303
144	NC_017233	TAT	2	6	4333	4338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206303
145	NC_017233	AATTGC	2	12	4371	4382	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384206303
146	NC_017233	ATT	3	9	4394	4402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017233	T	8	8	4412	4419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017233	AATA	2	8	4423	4430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017233	A	6	6	4433	4438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017233	TTA	2	6	4493	4498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017233	TAA	2	6	4527	4532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017233	ATT	2	6	4577	4582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206304
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167	NC_017233	AT	3	6	5044	5049	50 %	50 %	0 %	0 %	384206305
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420	NC_017233	A	7	7	12684	12690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_017233	GTT	2	6	12729	12734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_017233	TTA	2	6	12788	12793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_017233	A	7	7	13247	13253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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